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PCR Reaction Doubling Time Estimator

Esta herramienta traduce una eficiencia de amplificación por ciclo y una duración media de ciclo en un tiempo equivalente de duplicación. Utiliza un modelo exponencial en el que la cantidad se multiplica por (1 + E) en cada ciclo, donde E es la eficiencia expresada como fracción.

El resultado ayuda a interpretar el ritmo teórico de crecimiento de amplicón bajo una eficiencia constante. No representa el comportamiento completo de una PCR real, que atraviesa fases y puede perder eficiencia a medida que se consumen reactivos. Para qPCR, la eficiencia suele evaluarse con métodos específicos como curvas estándar; esta estimación no los sustituye.

Datos de entrada

%
min
Resultado
—
minutos por duplicación equivalente
Ciclos por duplicación—
Factor por ciclo—
Duplicaciones por hora—

1. Introduce la eficiencia
Usa la eficiencia de amplificación estimada por ciclo, expresada como porcentaje entre 0 y 100.

2. Añade la duración media del ciclo
Incluye una duración media representativa del ciclo térmico completo en minutos.

3. Consulta los ciclos necesarios
La calculadora determina cuántos ciclos equivalen a una duplicación con esa eficiencia.

4. Convierte a tiempo
Multiplica internamente los ciclos por la duración media para obtener el tiempo equivalente.

5. Interpreta con cautela
La eficiencia puede cambiar durante la reacción; utiliza el resultado como descripción simplificada del régimen exponencial.

Ciclos por duplicación = ln(2) ÷ ln(1 + E)
Tiempo de duplicación = Ciclos por duplicación × Tiempo por ciclo

E es la eficiencia como decimal: 90 % = 0,90. Con eficiencia del 100 %, el factor por ciclo es 2 y una duplicación corresponde a un ciclo.

Qué significa el resultado

El resultado indica cuánto tiempo de ciclaje correspondería a duplicar la cantidad de producto si la eficiencia introducida se mantuviera constante.

La PCR real no mantiene necesariamente una eficiencia constante durante todos los ciclos, por lo que este valor es una equivalencia de modelo, no una medición cinética completa.

Datos: eficiencia del 90 % y ciclo medio de 2,5 min.

Cálculo: E = 0,90; factor por ciclo = 1,90. Ciclos por duplicación = ln(2) ÷ ln(1,90) ≈ 1,080. Tiempo = 1,080 × 2,5 ≈ 2,70 min.

Resultado: aproximadamente 2,70 minutos por duplicación equivalente.

¿Qué significa una eficiencia del 100 %?

En este modelo significa que la cantidad se duplica en cada ciclo, es decir, un factor de crecimiento de 2 por ciclo.

¿Puede usarse el tiempo total del programa en lugar del tiempo por ciclo?

No directamente. La fórmula necesita una duración media por ciclo; tiempos de calentamiento inicial o extensiones finales no deben repartirse sin criterio.

¿Por qué se usa logaritmo en la fórmula?

Porque la amplificación se modela como crecimiento exponencial. El logaritmo permite calcular cuántos ciclos hacen falta para alcanzar exactamente un factor 2.

¿El tiempo de duplicación es constante durante toda la PCR?

No necesariamente. A medida que cambian las condiciones de la reacción, la eficiencia puede disminuir y el modelo deja de ser uniforme.

¿Es equivalente a calcular eficiencia de qPCR con una curva estándar?

No. Una curva estándar estima eficiencia a partir de la pendiente de Ct frente a concentración; esta herramienta parte de una eficiencia ya conocida para convertirla en un tiempo equivalente.